Bioinformática em português
Do dado bruto ao conhecimento biológico¶
Olá! Sou o Márcio, pesquisador de bioinformática. Aqui ficam, em versão completa e com referências, as postagens do @MWInSilico, junto com os meus scripts e tutoriais de análise de dados ômicos.
Comece por uma série
Os textos foram escritos para serem lidos em sequência — cada um parte de onde o anterior parou.
Série 1
Fundamentos¶
Os conceitos que sustentam qualquer análise em bioinformática.
- O Dogma Central evoluiuDNA → RNA → proteína, e tudo o que a biologia descobriu depois.
- Sequenciamento de DNADe Sanger ao Nanopore: como aprendemos a ler o genoma.
Série 2
Como medimos o transcriptoma¶
Três tecnologias, cada uma resolvendo um limite da anterior.
- RNA-Seq bulkA fotografia média da expressão gênica.
- RNA-Seq de célula únicaA heterogeneidade que a média esconde.
- Transcriptômica espacialOnde, no tecido, cada célula estava.
Série 3
O que sai do sequenciador¶
Os formatos de arquivo que aparecem em toda análise.
- Os arquivos do RNA-SeqFASTQ, FASTA, GTF, BAM e a matriz de contagens.
O que você encontra aqui
Três formatos, um mesmo objetivo: entender a biologia por trás dos dados.
Em preparação
Tutoriais práticos, passo a passo, que estão sendo revisados antes de entrar no site.
em revisão
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Acompanhe no Instagram¶
Novos posts saem primeiro no @MWInSilico e chegam aqui em versão completa.